@kalimba pour moi je dirais que le plus simple est le plus sûr est :
connecter ton disque dur sous windows et renommer recalbox en recalbox.old
brancher le disque dur sur le pi
démarrer le pi avec la nouvelle install sur carte SD
séléctionner le disque dur externe ou 'any external' dans recalbox
éteindre le pi, brancher le disque dur sur le pc
copier tout le contenu des répertoires bios, roms, saves, et screenshots de ceux de recalbox.old vers ceux de recalbox
optionnel quand il te propose l'écrasement des fichiers readme.txt et lisezmoi.txt lors de la copie du répertoire de bios, il faut mieux dire non
rebrancher sur le pi, relancer
éventuellement il te faudra supprimer les homebrews inclus par défaut dans recalbox si tu ne les veux pas