Bon, j'ai réussi à faire réapparaitre mes jeux NEO GEO dans le système ARCADE.
Pour cela il faut mettre l'option emulationstation.arcade.view.enhanced à 0 dans le recalbox.conf ou désactiver la "vue améliorée" dans les paramètres arcade de recalbox.
Effectivement, je doute que ce fonctionnement soit la volonté des dev 👷