Hola Dani, ¿estas intentando copiarlos via SD o con adaptador USB?
Al conectar la SD al linux, en mi caso se hace automaticamente el mount de 4 particiones. El tema esta en que el mount lo hace en solo lectura y eso es lo que no deja copiarte los juegos.
Es medio tedioso, y no se si es la mejor solucion, pero al menos lo vengo trabajando asi:
Abro una terminal y hago un remount a lectura/escritura de la particion share:
sudo mount /media/tomas/share -o remount,rw
(reemplaza tomas por tu usuario)
2. Copio los archivos con sudo con un:
cd [directorio de tus juegos]
sudo cp -rv * /media/tomas/share/roms/[emulador que quieras]
Si alguien conoce una mejor forma, agradeceria que lo comparta porque es tedioso...
Saludos!