@Fefo81 Ti consiglio di eseguire il backup di tutti i contenuti (per assicurarti che non te ne pentirai). MA, dopo aver formattato la pendrive, copia indietro solo quelle 3 cartelle come hai detto: ROMS, SAVES E BIOS.
Probabilmente stai affrontando una sorta di incompatibilità dovuta alle diverse versioni, come puoi vedere nel video, per assicurarti di non avere problemi, si consiglia di ripetere lo scrap per aggiornare le liste dei giochi.
Il tema è anche qualcosa che può causare problemi, utilizzare il tema predefinito per testare o utilizzare un tema che è già stato aggiornato alla versione 7.0: https://forum.recalbox.com/category/14/themes-interface