Ne faites pas de trou(s). Cela ne sert à rien. J'ai reçu mes ventilateurs aujourd'hui et pu tester le circuit du Nespi. Le ventilateur et la fiche qui entre au niveau du GPIO sont tous les 2 directement connectés à l'alimentation, alors pas de foreuse pour Noel 
Le problème vient surement du Hub USB. Pourquoi ? Parce qu'il n'est pas autoalimenté mais prend tout son jus sur le Hub 1 (ou autre) du Raspberry.
Le chip sur le Raspberry PI 2,3 qui s'occupe des ports USB n'a en fait q'un seul port USB, il en fait déja un Hub de 4! au niveau du Pi. Enplus il alimente non seulement les ports USB mais aussi le port Ethernet, qui fonctionne comme adaptateur USB --> Ethernet.
Alors sur cet pauvre Chip (LAN9514) on raccorde un HUB de HUB de 4 enplus. Pervers, non ? Et le Nespi Hub prend tout son jus directement sur le chip, rien sur l'alimentation en direct.
Alors, ou bien, si vous n'avez pas besoin de HUB extérieur, le déconnecter est le meilleur moyen. Surtout aujourdh'ui on trouve des USB-Stick mémoire qui ont encore assez de place pour raccorder directement à l'intérieur.
En tout cas éviter de mettre des trucs dessus qui sucent trop de jus.
Une dernière possibilité, mettre au niveau de config.txt la ligne
max_usb_current=1