@Pepe OK. Gracias por la explicación. Al final he encontrado ésto: http://mupen64plus.org/wiki/index.php?title=ControllerSetup y he copiado los valores de los a**lógicos y hecho corrección de los ejes. En ese link de la wiki aparece configurado el AnalogPeak exactamente igual a como yo lo tenía (ambos en positivo). Estás realmente seguro de que uno de los valores debe ir en negativo?
De todos modos lo intentaré. Por probar...
Después de mapear de nuevo, ahora funciona en Castelvania pero no en Duken Nuken ni en los demás juegos que mencioné antes. El problema es que, depende de en que juegos, me invierte los a**lógicos (desplaza**e con el stick derecho y movimiento de cámara con el izquierdo) y es bastante incómodo. Todavía no logro entender por qué pasa eso... un misterio!