@f0xhound por si acaso, este problema ya fue reportado a libretro y en teoria existe una forma de hacerlo funcionar, pero el desarrollador no se si lo implemento o simplemente no escribio el tutorial.

https://github.com/libretro/snes9x/issues/85

Actualizacion: Parece que si se “corrigio”, pero no completamente. Mira los comentarios en:
https://github.com/libretro/snes9x/pull/160

Ya encontre el problema, es del tema, algun problema tendra con la nueva version.
Si configuras el tema por defecto ya funciona perfectamente.
Un saludo.

@paradadf gracias

@paradadf ya lo he conseguido solucionar. El fallo venia de haberle hecho overclock, bastó con volverla a poner en modo normal... Muchas gracias por las respuestas.

@ezequiel47 prueba utilizando otro puerto hdmi o cambiando el cable hdmi.

@Pepe genioooo funciono de maravillas!!!! ahora puedo ir para abajo sin q aparesca la pantalla negra!! muchas gracias

Solucionado

descargue la imagen 4.0.1 y cambie los archivos dentro de la carpeta OS/raspberrypi3/ root.tar.xz y boot.tar.xz
descargados de aqui https://archive.recalbox.com/updates/v1.0/unstable/

@carlosbuleo @carlosbuleo hola, consulta queria saber si pudieron resolver actualizando recalbox el problema de la pantalla negra al volver?. por otro lado cuando se actualiza el recalbox se pierden los juegos? escuche que hay problemas con la resolucion. aguardo sus respuestas gracias

Conseguí otra versión y funcionó

saludos