@Zing Obrigado pelo apoio 🙂
Mas para deixar registrado, eu consegui aqui achar o problema depois de fazer vários testes e diversas pesquisas, não sobre o assunto, pois não tem nada semelhante...

Bem, para ter a funcionalidade do controlador para o Libreto, terá que fazer o mapeamento do controle dentro do Retroarch e salvar para que o mesmo crie o arquivo de mapeamento .cfg dentro da pasta: "\share\system.config\retroarch\autoconfig", pois o parâmetro "n64.configfile=whatever" cancela toda a configuração do Libreto.

Obs: Quando digo "toda configuração" não é só o controlador, mas tudo mesmo (parâmetros de vídeo, etc). Tem que refazer tudo pelo Retroarch tb.

A documentação do libreto no link abaixo explica como fazer a configuração do controlador:
https://docs.libretro.com/guides/joypad-autoconfiguration/#metadata

Ah, e detalhe, se quiser habilitar os botões de atalho, terá que editar na "unha" o arquivo .cfg lá na pasta "...\autoconfig"

Gracias, parece ser que convirtiendo los oggs al formato de ogg con esas características deja de dar cuelgues y va bien el entrar y salir de las roms. Seguiremos probando

@rené-alfonso-ortega-cáceres por favor comparte ...Abrazo

Pues en eso quedamos, este finde quiero hacer una instalacion Limpia de la 4.0.1 y actualizar a la 4.1, lo pongo en práctica, y actualizo la wiki. Muchas Gracias.

Se me a actualizado a la versión master-rpi3-build-10749966. No tengo ni idea de si es oficial o inestable, pero ya por fin puedo emparejar el gamepad correctamente.
Muchas gracias.
Lo doy por cerrado.