@kracerux yo que vos intento (por hardware) olvidar el emparejamiento del control y el receptor (ni idea como se hara, googlealo), y volveria a emparejarlo. Quiza eso lo solucione.
Hasta la 4.0.X se utiliza el driver xboxdrv en recalbox.conf para tener mejor soporte de estos mandos, pero a partir de la 4.1 se cambio a un controlador nativo del kernel y no un driver externo como el que te mencione. Ese controlador antiguo ha dejado de tener soporto y actualizaciones hace mas de un año, por eso puede ser que afecte a algunas versiones del mando (cuestiones de firmware supongo).
La version 4.1 unstable ha sido lanzada oficialmente, pero tal y como su nombre lo dice, es inestable. Tiene muchos fallos y en realidad no esta pensada para el uso diario (todavia). Si aun sabiendo eso queres probarlo, podes hacerlo actualizando segun indica el blog.
https://www.recalbox.com/blog/blog-2017-02-19-rb4.1
