As tu essayer un autre pack de rom NES? (conseil; cherche les No-Intro)
effacer le fichier config je crains en effet que ca ne serve a pas grand chose d'apres ce que tu dis.
As tu mis des shaders? As tu une icone d'un eclair jaune dans le coin haut-droit de ton ecran?
Ton SSD consome plus qu'une clé USB, si le Rpi ou le SSD manque de courant la vitesse d'execution est réduite.
Si trop chaud le Rpi reduit aussi sa vitesse, ca tu peut le voir si icone du thermometre.
un boitier? si oui lequel?