@dgteles Infelizmente acredito que isso não é possível, veja esse post:
https://forum.recalbox.com/topic/26304/gpi-case-2-cm4-with-internal-emmc-sd-card/5
Traduzindo o que diz:
"Se você olhar para a placa CM4 IO oficial da Raspberry Foundation, ela diz bem na placa que o cartão micro SD não pode ser usado nos CM4s com eMMC"
Acredito que ele esteja se referindo a este arquivo:
https://datasheets.raspberrypi.com/cm4io/cm4io-datasheet.pdf
Na página 12, dê um zoom na "Figure 5. CM4 GPIO" e você econtrará o texto "NB SD signals are only availableon modules without eMMC".