@adri10499 El problema que yo veo no es que le vaya a pasar algo Recalbox y este deje de funcionar por esta instalación, de hecho, si le pasase algo a Recalbox por ello, siempre tendría solución.
El problema que veo es que no vas a poder seguir ese tutorial de instalación tal cual, en una instalación normal de Recalbox ya que por lo que veo recurre a gestor de paquetes y repositorios, inexistentes en recalbox.
Recalbox no es un linux standard, es un sistema operativo por si mismo, basado en nucleo linux, pero ahí se acaban sus parecidos con cualquier sistema linux standard, por tal motivo no hay gestor de paquetes ni repositorios como tal, necesarios para poder seguir el tutorial que indicas.
vas a tener que buscar otra manera de obtener, instalar y configurar los paquetes necesarios para hacer tu owncloud en raspberry.
Una instalación dual Recabox/distro linux te podría servir, una vez hecho instalarías tu owncloud, tal como indica el tutorial, en la distribución linux que instales junto a Recalbox, echa un vistazo a los enlaces.
https://github.com/recalbox/recalbox-os/wiki/Setup-a-dual-boot-raspbian-recalboxOS-(EN)
https://github.com/recalbox/recalbox-os/wiki/Setup-a-dual-boot-archlinux-recalboxOS-(EN)
