Resolvido!
O que acontece é que o recalbox por padrao sempre deixa alguma rom de algum sistema, e essa rom nao aparece na pasta rom, pois ela fica na pasta share_init que é uma pasta que é lida toda vez que inicializa o recalbox, e é acessível somente por SSH, entao voce entra nela e entra na pasta roms e voila, o emulador tem rom dentro, e entao voce apaga tudo de dentro da pasta do emulador, e ele nao encomoda mais aparecendo na tela, a equipe bem que poderia facilitar isso em algum update, colocando uma opcao para ocultar o emulador na tela