j'ai mois aussi le même pb avec 2 manettes ps3 officiel non détecté par recalbox 4.0 dernière beta 5 en bluetooth. En usb pas de pb.
j'ai :
Branche le cable micro usb avec la manette ps3 attendre 10 sec pendant le clignotement lent débrancher et appuyer sur home
vérifier que le driver est bien sur "official" dans le recalbox conf (après avoir vérifié que tes manettes sont bien des officielles);
réinitialise les manettes (en insérant un objet fin dans le trou prévu à cet effet au dos de la manette);
dans le menu d'ES, demander à "oublier toutes les manettes associées" et toujours le meme pb