@fredlepp La N64 fonctionne parfaitement avec l'immense majorité des jeux sur Rpi3B+ (note le "plus" qui fait la différence avec le tien, cf ce comparatif pour plus de détails).
La version de Recalbox pour Rpi3B (le tien) est la même que celle pour le Rpi3B+ (le modèle au dessus du tien), c'est pour ça que la N64 n'a pas été désactivée (ça aurait privé les possesseurs de Rpi3B+). Ça aurait été d'autant plus dommage de désactiver la N64 dans cette version que, comme l'a très justement dit @acris : le N64 marche relativement bien sur Rpi3B avec un overclock.
J'espère que ça répond à ta première question.
Quant à ta seconde question ("laquelle faut-il acheter alors?"), je te conseille volontiers le Pi3B+ (attention à ne pas refaire l'erreur d'acheter la dernière version : le Rpi4 n'est pas encore compatible Recalbox).