Bonjour,
Réponse un peu tardive car je viens de m'inscrire (mais ça pourra servir à d'autres...):
Je viens de me monter une Recalbox 4.0.2, et j'ai constaté ça aussi avec une manette Xbox 360 sans fil + dongle officiel.
Il a suffit d'activer le pilote "xboxdrv" pour manettes Xbox dans le fichier recalbox.conf pour que le phénomène disparaisse, et que seul un segment soit allumé sur la manette.
En espérant avoir été utile....