bon j'ai réussi a réactivé ça, en fouillant dans les dossier par WinSCP, et activant les droit d'écriture,
puis modifiant le fichier recalbox.conf qui ce trouve ici : /recalbox/share_init/system/

ça doit être un bug qu'en modifiant le fichier par la page web, ça ne fonctionne pas, ni sur le fichier boot...

mais bon si ça peut aider quelqu'un, c'est la solution ^^