Merci pour ta réponse greenalex.
J'utilise également WinSCP. J'ai bien modifié le fichier boot ainsi que le config.txt. J'ai également inséré des fichiers .cfg pour chaques émulateurs. Exemple pour snes.cfg:
aspect_ratio_index = "22"
video_smooth = "false"
video_scale_integer = "false"
video_threaded = "false"
custom_viewport_width = "1792"
custom_viewport_height = "224"
custom_viewport_x = "118"
custom_viewport_y = "17"
Je le place ensuite dans recalbox/share/system/.config/retroarch
Magré cela, j'ai un menu recalbox nickel:

mais lorsque je lance un jeu, j'ai l"image suivante :

Du coup je fais Hotkey+B mais j'arrive à ça:

Duc oups, difficile de régler quelque chose.
Je pense que mes fichiers .cfg sont au mauvais endroit, mais où alors ?