Hello les gens,
@rockaddicted m'a filé un coup de main sur le sujet via IRC, un gros merci à lui.
Quant à la méthode de @Mikozzz en effet elle est incorrecte. Par contre son pack de bezels est bien pratique et normalement il a paramétré déjà toutes les tailles correspondantes, et ça c'est cool !
Suite a son tuto vous aurez pas mal d'emmerdes avec des données globales qui seront écrasées, vos sauvegardes par exemple risquent de se faire dans le répertoire du dernier systeme depuis lequel vous avez fait "save core overrides"
Il ne faut surtout pas faire ça !
Pour rattraper le coup, virez tout ce que contient le dossier : /recalbox/share/system/.config/retroarch
ce sera recréé proprement après un reboot.
Ensuite il faut suivre le tuto du wiki : https://github.com/recalbox/recalbox-os/wiki/Retroarch-setup-overlays-(FR)#viewports-personnalisés
- bien désactiver le pixel perfect
- passer le game ratio à custom
Il ne faut rien paramétrer et sauvegarder via le menu retroarch, ce n'est pas propre.
Et par la même occasion rajoutez la ligne : input_overlay_opacity = "1.0000000" dans vos fichier .cfg pour profiter de votre overlay pleinemment 
Et oui en effet, Mikozzz fait ça pour aider mais il ne connait pas tout le fonctionnement, il bidouille et essaie d'en faire profiter la communauté. C'est bien, mais il faut aussi essayer de comprendre comment tout cela marche par soit-même.
Encore plus important, quand l'équipe Recalbox essaie de t'aider ca me parait assez malvenu de remettre leur parole en doute sans essayer de comprendre quoi que ce soit.