Das könnte wirklich das Problem sein.
Ich würde die 16GB Sandisk holen (alles Amazon Links)
https://www.recalbox.com/shop
Und dann einen USB Stick für deine Einstellungen und Roms.
Siehe hier:
https://github.com/recalbox/recalbox-os/wiki/Externer-USB-Speicher-benutzen-%28DE%29
Damit hast du dann eher keine Probleme mehr wenn die Karte abraucht o.ä. 😉
Ich habe mir dafür einen Mini-USB Stick geholt, sieht etwas schicker aus am pi.
Z.B. der Sandisk Cruzer 64GB welcher auch im Recalstore abgebildet ist.