Vorab schon einmal sorry für den Doppelpost, nach längerer Lösungssuche mein relativ simples Ergebnis zu meinem Problem (in der Hoffnung dies hilft anderen Usern weiter):
Es scheint als sei die lr-Snes9x-Version die in der neuesten Version von Recalbox enthalten ist an meinen Soundproblemen schuld. Meine MSU1-Spiele laufen unter Retropie mit der aktuellsten Version problemlos.
Ich hoffe dass auch Recalbox in naher Zukunft ein entsprechendes Update erhält! Werde bei Gelegenheit Problem und Lösung an geeigneter Stelle posten!