¡Hola! No estás haciendo nada mal; la restauración por defecto en Recalbox suele resetear ciertas carpetas para garantizar una configuración limpia, y lamentablemente, la carpeta de bootvideos es una de las que se vacía durante el proceso. Una posible solución sería hacer un respaldo manual de los archivos de bootvideos antes de la restauración y luego volver a colocarlos en la carpeta una vez que el sistema haya sido restaurado.