Quitte à refaire une install propre, vaut mieux utiliser une clé usb pour stocker les roms.
De plus recalbox créera dessus des fichiers systèmes et il y aura toutes les saves des jeux.
Plus facile de faire des sauvegardes fréquentes ou avant une MaJ et c'est plus fiable.
C'est d'ailleurs vraiment un des gros point fort pratique comparé à retropie...