Erro meu. Já estava funcionando e eu não tinha percebido.
Podem fechar o tópico.

Boa noite, galera.
Procurei, mas não encontrei no forum como usar as sobrecargas de configuração. Olhei na documentação do recalbox e só diz para salvar o arquivo .retroarch.cfg no diretório das roms que já funciona. Fiz isso, mas sem sucesso.
O que eu queria era deixar o retroarch com essa configuração:

video_threaded = true

Alguém sabe como usar essa função de sobrecarga? Se precisa ativar no recalbox.
Desde já, obrigado.