De mémoire (suis pas chez moi aujourd'hui), j'ai chopé toutes les roms en 60hz et je ne me souviens pas avoir eu de souci...
Sinon fais ta config dans le menu retroarch, sauvegarde la, et retrouve le fichier de config (a travers la connection reseau, depuis ton ordi) pour voir a quoi ressemble la ligne correspondante. Il y a énormément de lignes ds le fichier de config, mais tu devrais pouvoir la trouver en faisant une recherche sur "refresh rate" ou quelque chose comme ça.
Mais je peux vérifier ce soir si besoin !