Avec mon i5/GTX 970, même problème.
Mais si je force le chipset graphique intégré à la carte mère dans le bios, Recalbox tourne sans problème et fait tourner la GameCube à 60fps.
Dans ton cas, si c'est ton PC de tous les jours, je pense qu'il faut pouvoir activer les deux dans le bios, et ensuite brancher l'écran sur la sortie que tu veux (recalbox sur le hdmi de la carte mère) et le reste sur l'hdmi de la carte graphique.
Le problème de lag, c'est du au fait que les drivers ne supportent qu'une infime partie des cartes graphiques pour l'instant, car recalbox fonctionne sur linux.