Hola. Al final he optado por conectar los botones a los pines Gpio. Al encender recalbox las direcciones del joystick estaban cambiadas pero entré en el menú de configuración del mando, volví a asignar direcciones y botones y ahora me funciona todo perfectamente.
Voy a mandar el interface usb para que me lo repongan por otro nuevo, pues creo que el problema está en este componente.

Buenas tardes. Mi nombre es Carlos y tengo un pequeño problema con los joysticks de mi mando arcade.
Tengo una raspberry pi 3 y un interface usb para los botones y los joysticks.
He conseguido que el sistema me reconozca los dos mandos ( a través de un tutorial añadiendo unos comandos en la configuración de la raspberry) y me los deje configurar perfectamente. El problema viene al iniciar un juego. El jugador que primero mueva su joystick (da igual que lo haga el player 1 o el 2) no tiene problemas pero al otro jugador se le desconfiguran las direcciones del joystick (arriba y abajo pasan a ser derecha e izquierda y viceversa). Cuando juego sólo con un mando no me pasa.
¿Os ha pasado a alguno de vosotr@s? ¿Creéis que el interface está defectuoso?
Gracias de antemano por vuestra ayuda...