Bon je me répond à moi même.
N'aillant pas trouver de solution à mon problème j'ai reformaté ma clés USB (128g sandisk ultrafit), ensuite j'ai mis la clé usb vierge dans le rasp pour qu'il crée les répertoires et ensuite j'ai réinstallé uniquement les jeux PCengine cd.
Et là ça fonctionne bien avec le son !
Du coup je vais petit à petit rajouter les ROMS des autres systèmes.
Je vous tiendrai au courant.
A+