Also ich kenne dein Problem. Das Problem scheint die Größe der Dateien zu sein. Beste Lösung ist folgende: WINSCP. Das solltest Du unbedingt nutzen, denn selbst wenn Du die Dateien über den Windows Explorer kopierst kann es zu Verbindungsproblemen und fehlerhaften Dateien kommen.
WinSCP ist for free und eigentlich einfach zu bedienen. Auch hier habe ich öfters Verbindungsabbrüche beim kopieren der PSX Roms. Aber WinSCP kann die Übertragung dann einfach fortsetzen und muss nicht von vorne anfangen.