Pessoal, para quem interessar eu encontrei sozinho a resposta PARCIAL do problema.

Como eu nunca havia usado linux na vida, não sabia que o windows não lê todas as partições do cartão SD, criadas pelo Linux.

Assim, não é que a pasta /os está vazia, mas sim que o windows não deixa eu ver seu conteúdo. Se eu usar uma distro linux (o próprio raspbian que vem com o noobs já serve), eu consigo ver as partições e seu conteúdo.

O problema, agora, é que o raspbian diz que não tenho permissão para gravar nessas partições. O que é um saco, já que quero passar as roms direto pro cartão Sd.

É isso aí, espero ter ajudado quem tem o mesmo problema que eu, abraço