J'ai eu le même souci y a quelques jours quand j'ai refait mon install sur mon eeepc.
Le problème venait du fait que je n'avais que les 2 partitions "Boo"t & "Share" de créées.
La 3ème partition "Recalbox" n'avait pas été créée. J'ai réussi à résoudre le problème en la créant à la main et en rebootant.