Bon j'ai dû bidouiller chaque paramètre dans la config de Retroarch, et j'ai finis par trouver que c'était l'option de rembobinage qui faisait saccader le jeu. Pour fixer le problème de façon définitive j'ai placé un fichier .retroarch.cfg (comme indiqué dans la documentation) à l'emplacement "SHARE\roms\fbneo\.retroarch.cfg" et j'y ai écrit rewind_enable = false.