Désolé pour le monologue mais au moins ça peut servir à d'autres :
J'ai fait un reset d'usine de Recalbox ça n'a rien réglé.
Par contre, je suis aller renommer mon dossier 'recalbox' (en 'recalbox_disabled') dans mon premier disque dur (l'interne au PC, celui que j'ai abandonné au profit dun externe). Et bien cela a réglé mes problèmes de doublons!
Du coup, c'est comme si RB continuait à considérer mon ancien 'stockage' alors que dans l'interface ' réglages système/média' je l'ai pas sélectionné. RB parcourt-il tous les disques montés ?