En fait le problème est réglé pour les manettes de psx. Il fallait configurer les sticks des manettes et elles envoient bien un signal spécifique pour l'analogique.
Je crois que cela viens des manettes pour la gamecube... Elles envoient le même signal que les pads quand je change la config. Je ne pensais pas avoir le soucis sur kubii...